1921 metais po įstojimo Transilvanija prie Rumunijos pagal Sutarties nuostatas apie atvykimo Rumunijos į Pirmąjį pasaulinį karą besiremiantis į 1872 metais yra miesto Коложвар (vėliau Клуж-Напока) Transilvanija su mokymu apie vengrų kalba buvo perkeltas į Сегед. Iki 1940 m. universiteto велось mokymo keturių факультетах: medicinos, matematikos ir gamtos mokslų, teisine, o taip pat faculté meno, kalbų ir istorijos. Šiuo metu vienu iš universiteto profesorių buvo Albertas St-Дьерди - nobelio premijos laureatas pagal fiziologijos ir medicinos 1937 metų.

1940 metais, pagal es sprendimą Венского arbitražu, Rumunija buvo turi perleisti dalį Transilvanija Vengrijos, ir universitetas buvo perkeltas atgal į Клуж-Напоку, kas ir buvo padaryta, tačiau tuo pačiu metu Сегеде buvo atidarytas naujas Karališkasis universitetas vardo Миклоша Хорти, kuris po karo gavo pavadinimą Universiteto Сегеда. 1951 metais buvo упразднен medicinos fakultetą - į jo pagrindu buvo sukurtas medicinos institutas. 1962 metais universitetas gavo vardą vengrų poetą-revoliucionierius Аттилы Йожефа, kuris 1924 m. m. atvyko į Сегедский universitetas, bet buvo pašalinta už politinius eilėraščius.

2000 metais universitetas Сегеда laukė naujas pertvarkymas, dėl kurio įvyko asociacijos universiteto medicinos universiteto ir daugelio kitų mokslo įstaigų į vieną universitetas Сегеда.

Vienas iš atrakcionų Katedros aikštėje - muzikos laikrodis, esančius ant sienos pastato universiteto priešingai Piazza del duomo". Šie unikalūs laikrodžiai – darbas часовщика Ференца Цури ir резчика pagal medžio Йожефа Кулая.