Pagal трудам ярославских istorikų Афанасьевский vienuolynas buvo įkurtas po 1612 metais, tuo metu, kai šalia cerkvės Афанасия ir Kirilo į часовне įvyko mokykis чудотворной piktogramą Спаса Нерукотворного. Bet yra dokumentinių įrodymų to, kad šis vienuolynas buvo jau 16 į. 1615 m. Gabrielis Мякушкин, земский староста, kreipėsi į митрополиту ростовскому Кириллу su prašymu palaiminti pagrindas gyvenamajame į šventosios vietoje.

Yra dokumentiniai informacijos apie tai, kas Афанасьевский vienuolynas buvo valdoma игуменами. Pirmaisiais savo egzistavimo jis jau gavo nuosavybės ir privilegijos dėl грамотам Mykolo Федоровича. Pirmoji į raštingumą, датируемой 1619 m., buvo kalbama apie tai, kad Афанасьевский šv atleidžiamas nuo руги pinigų ir хлебной, žvakės, vynas, rūkymas. Taip pat монастырю выделялась vietą pagal malūnas ant Романовской ir Ярославской pusėje. Su miško malkos, kurios vienuolynas вез pagal Волге, Мологе ir Шексне norėdami монастырского обихода пошлина ne взималась. Vienuolynas taip pat освобождался nuo постоя воевод, бояр, kunigaikščių ir ратных žmonių.

Pirmieji pastatytas vienuolynas buvo mediniai, 17 v. gyvenamąjį ne kartą сгорала metu gaisrų. Taip, 1658 m. vienuolynas visiškai sudegė. Pirmoji roko bažnyčia ir vienuolynas garbę Афанасия ir Kirilo buvo pastatytas 1664 m. благословению митрополита ростовского Jonos Сысоевича. Baigus statyti bažnyčia buvo украшена росписями, nustatytus московскими amatininkai. Kai пожаре 1670 m. vienuolynas vėl kentėjo. Į 1676 m. prie соборной bažnyčios šiaurės-buvo пристроен žiemos šventykla su колокольней, kuris buvo освящен garbę митрополиту Московского Алексия. Į 1736 m. prašymu игумена vienuolyno Jonos ir указу arkivyskupo Иоакима prie Афанасьевскому монастырю приписали laikrodžio bokštą, пристроенную prie Знаменской arba Власьевской bokšte, kuri являлась въездными vartai į Žemė miestas. Šiandien ji žinoma pavadinimu Знаменской bažnyčios.

Афанасьевский šv reikšmingas niekada nebuvo nei pagal turtus savo valdų, nei skaičių иноков: 1717 m. čia жило tik septyni vienuoliai taip vienas белец; valst nėra išaugo ir, pasak 1802 m. Teritorija gyvenamajame buvo visiškai maža, ji ribota uolienų невысокой sienos tik su rytų ir šiaurės rytų. Dėl kitų šalims kaip tvora pasisakė монастырские надворные pastatymo обывательских namų, taip pat Спасо-Пробоинская bažnyčia.

Rytų, парадному фасаду vienuolyno, kuris vykdomas Пробойную gatvę, 18 į. turėjo padidėjusi dvi akmens bokštai mažų dydžių, viena iš jų atlikti vaidmenį Šventųjų vartų, į kitą patektų koplyčia garbę svarbaus įvykio − įkūr čia чудотворной piktogramą. Bokštai заканчивались шпилями su figūromis трубящих angelų.

Birželio 25, 1768 m. centras Ярославля dar kartą kilo gaisras. Į sąrašą sukelia žalą yra, iš tiesų, pirmoji aprašymas statinių Афанасьевского vienuolynas. Atliekant išteklių atkūrimo darbų buvo atnaujinta tapyba šventyklos Афанасия ir Kirilo, originalus akmuo иконостас pakeisti ir realiai medinis.

Į 1820-1830 m. į gyvenamosios buvo atlikti didelės apimties darbus, jo apželdinimo: buvo padidėjusi apatinės mūrinis настоятельские покои su трапезной палатой; buvo įrengtas dviejų neidentiški кельи; bažnyčios Афанасия ir Kirilo 1825 m. мещанин Konstantinas Требников изготовил savo lėšas naują иконостас, Aleksandras Чарышников iš Ярославля позолотил jo; 1831 m. šiltas šventykla украсили tapyba, росписи atliko Тимофей Lokys. Tuo pačiu metu buvo перестроена одноярусная mišios virš папертью šiltas bažnyčios, монастырю iš упраздненного Борисоглебского apylinkės buvo perduotas 115-пудовый varpas. Ansamblį колокольни vienuolyno sudarė septyni bay.

Kitas перестройкам Афанасьевский vienuolynas buvo sandūroje 19-20 вв.: 1897 m. buvo įrengtas mūrinis погреба, каретная, svirnas, pirtis, конюшня; 1903 ir 1907 m. buvo atliekami remonto darbai соборной bažnyčios priemonės, skirtos F. E. Вахрамеевым; 1912 m. buvo поновлена sieninė tapyba menininkas ir реставратором Pm Vi Дикаревым į donorystės A. Ir Вахромеева.

Į 1764 m. указу императрицы Jekaterinos II Афанасьевскую gyvenamąjį причислили prie заштатным. Gruodžio 12, 1857 m. Афанасьевская uostą buvo возведена laipsniu третьеклассной, настоятели jos jau nuo to laiko san архимандритов. Nuo 1895 m. Афанасьевский vienuolynas gavo statusas rezidencijos викарного vyskupas ярославской епархии.

Po revoliucijos, kai Афанасьевском монастыре buvo sukurta приходская bendruomenė. Vasario 1925 m. vienuolynas buvo uždarytas, dalis turto buvo perduota į šventyklą Спаса į Miestą ir kitos šventyklos. 1930-ųjų m. išspręsti miesto valdžios mišios buvo разобрана, o bažnyčios Афанасия ir Kirilo ir kitų монастырских постройках sėdėjo organizacijos, gamybinės dirbtuvės, братский korpusas buvo po būstą.

Lapkričio 2007 m. šventyklą su оградой ir bokštais Šventųjų vartų perdavė Rusijos Stačiatikių bažnyčios. Kai Ярославская dvasinė seminarija persikėlė į pastato dvaro Вахромеева dėl tolesnio elgesio su paketu valdovo Kirilo монастырский šventykla tapo семинарским. Sausio 31 d., 2008 m. приделе Алексия buvo atliktas pirmasis богослужение.